В 2012 году регион получит для реализации мероприятий программы 32,4 млн рублей из федерального бюджета. Таким образом, общий объем финансирования программы составляет 149 млн рублей, в том числе в 2012 году – 70 млн рублей.
Из них 66,5 млн рублей будут направлены на закупку диагностического оборудования для выявления и мониторинга лечения жителей, инфицированных ВИЧ и вирусами гепатитов В и С.